Berkat keberhasilan Itachi menghentikan Kabuto, Edo Tensei yang mengacaukan medan perang akhirnya dipatahkan! Tapi, kebencian Sasuke pada Konoha tetap tidak lenyap walau sudah melihat pengorbanan kakaknya. Apakah yang akan dikatakan Itachi padanya!? Sementara itu, pertarungan Naruto pun semakin sengit!
Naritp dan kawan-kawan akhirnya memperoleh petunjuk untuk menangkap laki-laki bertopeng! Kakashi yang berhasil membongkar kalau jurus musuh itu sejenis Kamui sempat terpaku karena merasakan firasat buruk. Sementara itu, satu serangan naruto yang mempercayai, teman-temannya dan terus maju akhirnya menghancurkan topeng tersebut!
Naruto difitnah sebagai pelaku percobaan pembunuhan sehingga dikiri ke sebuah penjara bernama Kastil Hozuki di Kusagakure! cakranya disegel dengan Tenro no Jutsu oleh Mui, sang kepala kastil, sehingga dia tak bisa kabur atau menggunakan ninjutsu. Namun, di sana ternyata sedang konspirasi yang melibatkan Kotak Surga, kotak yang konon akan mengabulkan segala permohonan orang yang berhasil membuka…
Untuk memperoleh kekuatan Kyubi, Naruto memulai latihan di pulau terpencil di Desa Kumogakure.Saat segel berhasil dibuka dengan meminjam kekuatan Bee, kesadaran Kyubi yang penuh niat jahat nyaris menguasai Naruto. Di tengah pertarungan alaam bawah sadarnya, Naruto mengalami pertemuan mengharukan!!
Sasuke gugur saat melindungi Naruto...!! Saat itu, terjadi keanehan pada diri Naruto! Haku yang terkena pukulan kemarahan pun menyadari hal tersebut. Sementara, pertarungan antara Zabuza vs Kakashi semakin sengit, siapakah yang menang!? Inilah babak akhir dari pergolakan di negara Nami!!
Obito akhirnya berubah menjadi jinchuriki Jubi. Kekuatan yang berasal dari biju tersebut begitu dahsyat sampai berhasil menghancurkan kekkail .Saat semua dilanda kecemasan, kemampuan edo tensei pada hokage memperlihatkan kegunaannya. Naruto dan sasuke pun berusaha mgnerahkan serangan balik, tapi.....
Mugen tsukuyomi sudah diaktifkan dan umat manusia terperangkap di dunia mimpi. Kaguya yang bangkit lewat Zetsu hitam mengisap semua cakra dan mulai beraksi! Dengan kekuatan yang diwariskan Ridudo Sennin, Naruto dan Sasuke menghadapi Kaguya yang harus disegel!!
Kaguya berhasil disegel dan perang besar pun berakhir. Namun, Sasuke memulai pemberontakan! Demi menyampaikan perasaan mereka yang selalu bertentangan, Naruto dan Sasuke pun saling berhadapan. Inilah akhir pertarungan yang mempertaruhkan segalanya di antara dua orang Pahlawan!
Perang terus berlanjut! Tentara gabungan shinobi harus bertarung melawan para ninja hebat yang dibangkitkan. Darui, komandan pasukan 1, yang berjaga di garis depan pun berhadapan dengan Kinkaku dan Ginkaku bersaudara yang dijuluki shinobi legendaris Kumogakure! Bisakah pemilik cakra Kyubi dan senjata ninja mengerikan itu dikalahkan!?
"Kalau begitu, jadi lebih kuat dari itu juga beres, kan!?"... Kakashi meenyarankan metode latihan yang mengejutkan pada Naruto yang tidak bisa membawa Sasuke kembali karena perbedaan kekuatan yang begitu besar! Di saat yang sama, duo baru Akatsuki terus mendekat ke negara 'Hi'...!!
Rock Lee adalah ninja dengan trade mark alis tebal yang punya tujuan"jadi ninja hebat sekalipun tidak menguasai nunjutsu". Bersama dengan Tenten dan Neji yang satu tim dengannya di tim Guy, Rock Lee di desa Konohagakure dengan latihan. Dan hari ini pun Rock Lee berlatih dengan penuh semangat!
Untuk memancing Naruto ke medan pereang, Madara mengacaukan situasi garis depan dengan kemampuan Zetsu Putih. Naruto yang bisa mendeteksi musuh pun bergegas ke semua lokasi pertempuran untuk menolong teman-temannya! Sementara itu, Gaara dan Onoki harus menghadapi para Kage terdaulu!
Untuk melampaui Hokage Keempat!! Latihan Naruto juga memasuki babak terakhir dan diteruskan dengan pemahaman jurus baru level S. Di lain pihak, Kelompok Asuma yang mencari Akatsuki akhirnya bisa menangkap target! Penyergapan Shikamaru dan yang lain berhasil, tapi di hadapan kemampuan musuh yang mengerikan!?
Telah hadir Naruto Official Animation Book full color yang membahas tentang anime Naruto dari episode 1-37! Di sini akan diperlihatkan juga gambar desain Tetsuya Nishio dan Hirofumi Suzuki yang belum dipubliikasikan sebelumnya, interview dengan pengisi suara anime-nya, tanya-jawab dengan Masashi Kishimoto-sensei, juga informasi rahasia yang wajib diketahui oleh kalian yang menonton anime Naruto!.
Naruto mulai berlatih setelah bertemu dengan Sennin Katak misterius sebelum babak utama 'tes ketiga'. Di waktu yang berbeda, Dosu yang menantang Gaara dikalahkan dalam sekejap...Sementara, terdi sesuatu antara Kabuto dan Baki si Jaonin dari Suna!! Kini, perjanjian yang mengerikan mulai terlihat!!